Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkag1O54950 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkag1O54950 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkag1O54950 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkag1O54950 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkag1O54950 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkag1O54950 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkag1O54950 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkag1O54950 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkag1O54950 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkag1O54950 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prkag1O54950 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prkag1O54950 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkag1O54950 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkag1O54950 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkag1O54950 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkag1O54950 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkag1O54950 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkag1O54950 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkag1O54950 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkag1O54950 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prkag1O54950 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkag1O54950 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkag1O54950 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkag1O54950 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkag1O54950 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkag1O54950 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkag1O54950 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkag1O54950 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkag1O54950 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkag1O54950 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkag1O54950 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag1O54950 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkag1O54950 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkag1O54950 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkag1O54950 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkag1O54950 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkag1O54950 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkag1O54950 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkag1O54950 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkag1O54950 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkag1O54950 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkag1O54950 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkag1O54950 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkag1O54950 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Prkag1O54950 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkag1O54950 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkag1O54950 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkag1O54950 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkag1O54950 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkag1O54950 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkag1O54950 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkag1O54950 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkag1O54950 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkag1O54950 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkag1O54950 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkag1O54950 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkag1O54950 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkag1O54950 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkag1O54950 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkag1O54950 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkag1O54950 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkag1O54950 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkag1O54950 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkag1O54950 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prkag1O54950 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkag1O54950 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkag1O54950 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkag1O54950 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkag1O54950 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkag1O54950 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkag1O54950 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkag1O54950 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkag1O54950 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkag1O54950 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkag1O54950 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkag1O54950 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkag1O54950 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkag1O54950 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms