Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Csnk2a2O54833 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csnk2a2O54833 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csnk2a2O54833 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csnk2a2O54833 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csnk2a2O54833 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csnk2a2O54833 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csnk2a2O54833 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csnk2a2O54833 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Csnk2a2O54833 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Csnk2a2O54833 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Csnk2a2O54833 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Csnk2a2O54833 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Csnk2a2O54833 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Csnk2a2O54833 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Csnk2a2O54833 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csnk2a2O54833 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Csnk2a2O54833 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Csnk2a2O54833 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Csnk2a2O54833 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csnk2a2O54833 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csnk2a2O54833 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Csnk2a2O54833 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Csnk2a2O54833 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Csnk2a2O54833 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csnk2a2O54833 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csnk2a2O54833 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Csnk2a2O54833 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csnk2a2O54833 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csnk2a2O54833 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk2a2O54833 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Csnk2a2O54833 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csnk2a2O54833 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Csnk2a2O54833 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csnk2a2O54833 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csnk2a2O54833 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csnk2a2O54833 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Csnk2a2O54833 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Csnk2a2O54833 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csnk2a2O54833 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Csnk2a2O54833 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csnk2a2O54833 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csnk2a2O54833 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csnk2a2O54833 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csnk2a2O54833 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csnk2a2O54833 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Csnk2a2O54833 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csnk2a2O54833 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csnk2a2O54833 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms