Protein–RNA interactions for Protein: O35730

Ring1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ring1O35730 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ring1O35730 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ring1O35730 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ring1O35730 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ring1O35730 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ring1O35730 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ring1O35730 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ring1O35730 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ring1O35730 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ring1O35730 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ring1O35730 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ring1O35730 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ring1O35730 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ring1O35730 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ring1O35730 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ring1O35730 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ring1O35730 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Ring1O35730 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ring1O35730 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ring1O35730 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ring1O35730 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ring1O35730 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ring1O35730 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ring1O35730 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ring1O35730 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ring1O35730 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ring1O35730 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ring1O35730 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Ring1O35730 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ring1O35730 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ring1O35730 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Ring1O35730 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ring1O35730 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Ring1O35730 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ring1O35730 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ring1O35730 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ring1O35730 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ring1O35730 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Ring1O35730 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ring1O35730 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ring1O35730 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ring1O35730 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ring1O35730 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ring1O35730 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ring1O35730 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ring1O35730 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ring1O35730 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Ring1O35730 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ring1O35730 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ring1O35730 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ring1O35730 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ring1O35730 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ring1O35730 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ring1O35730 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ring1O35730 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ring1O35730 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ring1O35730 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ring1O35730 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ring1O35730 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,55■■■□□ 2
Ring1O35730 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ring1O35730 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Ring1O35730 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ring1O35730 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Ring1O35730 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ring1O35730 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Ring1O35730 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ring1O35730 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ring1O35730 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ring1O35730 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ring1O35730 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ring1O35730 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ring1O35730 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ring1O35730 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ring1O35730 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ring1O35730 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ring1O35730 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ring1O35730 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ring1O35730 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ring1O35730 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms