Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ppfibp2O35711 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ppfibp2O35711 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppfibp2O35711 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ppfibp2O35711 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ppfibp2O35711 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ppfibp2O35711 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ppfibp2O35711 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ppfibp2O35711 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ppfibp2O35711 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ppfibp2O35711 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ppfibp2O35711 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ppfibp2O35711 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Ppfibp2O35711 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ppfibp2O35711 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ppfibp2O35711 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ppfibp2O35711 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ppfibp2O35711 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ppfibp2O35711 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ppfibp2O35711 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ppfibp2O35711 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ppfibp2O35711 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ppfibp2O35711 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ppfibp2O35711 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ppfibp2O35711 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ppfibp2O35711 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ppfibp2O35711 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ppfibp2O35711 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ppfibp2O35711 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ppfibp2O35711 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ppfibp2O35711 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ppfibp2O35711 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ppfibp2O35711 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Ppfibp2O35711 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ppfibp2O35711 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ppfibp2O35711 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ppfibp2O35711 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ppfibp2O35711 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ppfibp2O35711 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ppfibp2O35711 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Ppfibp2O35711 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ppfibp2O35711 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ppfibp2O35711 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ppfibp2O35711 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ppfibp2O35711 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ppfibp2O35711 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Ppfibp2O35711 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ppfibp2O35711 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ppfibp2O35711 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ppfibp2O35711 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Ppfibp2O35711 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ppfibp2O35711 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ppfibp2O35711 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ppfibp2O35711 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ppfibp2O35711 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ppfibp2O35711 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ppfibp2O35711 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ppfibp2O35711 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ppfibp2O35711 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ppfibp2O35711 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ppfibp2O35711 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ppfibp2O35711 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ppfibp2O35711 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ppfibp2O35711 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Ppfibp2O35711 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ppfibp2O35711 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ppfibp2O35711 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ppfibp2O35711 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ppfibp2O35711 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ppfibp2O35711 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ppfibp2O35711 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ppfibp2O35711 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ppfibp2O35711 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ppfibp2O35711 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ppfibp2O35711 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ppfibp2O35711 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ppfibp2O35711 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ppfibp2O35711 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ppfibp2O35711 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ppfibp2O35711 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ppfibp2O35711 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ppfibp2O35711 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ppfibp2O35711 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ppfibp2O35711 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms