Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
C1dO35473 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
C1dO35473 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
C1dO35473 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
C1dO35473 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
C1dO35473 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1dO35473 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
C1dO35473 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,06■■□□□ 1,6
C1dO35473 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
C1dO35473 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
C1dO35473 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
C1dO35473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
C1dO35473 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
C1dO35473 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
C1dO35473 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
C1dO35473 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
C1dO35473 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
C1dO35473 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
C1dO35473 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1dO35473 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
C1dO35473 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
C1dO35473 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
C1dO35473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
C1dO35473 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
C1dO35473 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,8■■□□□ 1,56
C1dO35473 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
C1dO35473 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
C1dO35473 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
C1dO35473 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
C1dO35473 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
C1dO35473 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
C1dO35473 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
C1dO35473 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
C1dO35473 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
C1dO35473 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
C1dO35473 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
C1dO35473 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
C1dO35473 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
C1dO35473 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
C1dO35473 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
C1dO35473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
C1dO35473 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
C1dO35473 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
C1dO35473 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
C1dO35473 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,49■■□□□ 1,51
C1dO35473 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
C1dO35473 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
C1dO35473 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
C1dO35473 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
C1dO35473 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
C1dO35473 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
C1dO35473 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
C1dO35473 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
C1dO35473 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
C1dO35473 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
C1dO35473 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
C1dO35473 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
C1dO35473 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
C1dO35473 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
C1dO35473 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
C1dO35473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
C1dO35473 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
C1dO35473 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
C1dO35473 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
C1dO35473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
C1dO35473 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
C1dO35473 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
C1dO35473 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
C1dO35473 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
C1dO35473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
C1dO35473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
C1dO35473 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
C1dO35473 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
C1dO35473 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
C1dO35473 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
C1dO35473 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
C1dO35473 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
C1dO35473 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
C1dO35473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
C1dO35473 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
C1dO35473 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
C1dO35473 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
C1dO35473 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
C1dO35473 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
C1dO35473 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
C1dO35473 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
C1dO35473 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
C1dO35473 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
C1dO35473 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
C1dO35473 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
C1dO35473 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1,43
C1dO35473 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
C1dO35473 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
C1dO35473 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
C1dO35473 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,95■■□□□ 1,42
C1dO35473 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
C1dO35473 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
C1dO35473 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
C1dO35473 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
C1dO35473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
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