Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1dO35473 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1dO35473 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1dO35473 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1dO35473 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1dO35473 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1dO35473 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1dO35473 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1dO35473 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1dO35473 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1dO35473 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1dO35473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1dO35473 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1dO35473 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1dO35473 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1dO35473 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1dO35473 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1dO35473 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1dO35473 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1dO35473 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1dO35473 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1dO35473 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1dO35473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1dO35473 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1dO35473 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1dO35473 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1dO35473 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1dO35473 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1dO35473 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1dO35473 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1dO35473 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1dO35473 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1dO35473 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1dO35473 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1dO35473 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1dO35473 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1dO35473 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1dO35473 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1dO35473 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1dO35473 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1dO35473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1dO35473 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1dO35473 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1dO35473 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1dO35473 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1dO35473 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1dO35473 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1dO35473 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1dO35473 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1dO35473 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1dO35473 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1dO35473 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1dO35473 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1dO35473 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1dO35473 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1dO35473 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1dO35473 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1dO35473 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1dO35473 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1dO35473 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1dO35473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1dO35473 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1dO35473 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1dO35473 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1dO35473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1dO35473 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1dO35473 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1dO35473 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1dO35473 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1dO35473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1dO35473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1dO35473 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1dO35473 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1dO35473 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1dO35473 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1dO35473 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1dO35473 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1dO35473 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1dO35473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1dO35473 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1dO35473 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1dO35473 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1dO35473 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1dO35473 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1dO35473 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1dO35473 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1dO35473 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1dO35473 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1dO35473 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1dO35473 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C1dO35473 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1dO35473 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1dO35473 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1dO35473 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1dO35473 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1dO35473 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1dO35473 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1dO35473 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1dO35473 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1dO35473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms