Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6aO35464 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6aO35464 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema6aO35464 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6aO35464 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6aO35464 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema6aO35464 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6aO35464 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6aO35464 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6aO35464 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6aO35464 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6aO35464 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6aO35464 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6aO35464 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6aO35464 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6aO35464 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6aO35464 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6aO35464 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6aO35464 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6aO35464 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6aO35464 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6aO35464 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6aO35464 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6aO35464 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6aO35464 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6aO35464 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6aO35464 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6aO35464 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6aO35464 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6aO35464 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6aO35464 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6aO35464 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6aO35464 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6aO35464 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6aO35464 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema6aO35464 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6aO35464 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema6aO35464 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6aO35464 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6aO35464 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6aO35464 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6aO35464 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6aO35464 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6aO35464 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6aO35464 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6aO35464 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6aO35464 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6aO35464 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6aO35464 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema6aO35464 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6aO35464 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema6aO35464 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6aO35464 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6aO35464 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6aO35464 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms