Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Pkd2O35245 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Pkd2O35245 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Pkd2O35245 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Pkd2O35245 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Pkd2O35245 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Pkd2O35245 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Pkd2O35245 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Pkd2O35245 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,07
Pkd2O35245 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Pkd2O35245 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Pkd2O35245 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Pkd2O35245 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Pkd2O35245 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Pkd2O35245 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Pkd2O35245 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Pkd2O35245 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Pkd2O35245 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Pkd2O35245 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40,23■■■■■ 4,03
Pkd2O35245 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Pkd2O35245 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Pkd2O35245 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Pkd2O35245 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Pkd2O35245 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
Pkd2O35245 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Pkd2O35245 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Pkd2O35245 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Pkd2O35245 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,94■■■■□ 3,98
Pkd2O35245 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Pkd2O35245 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,86■■■■□ 3,97
Pkd2O35245 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Pkd2O35245 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Pkd2O35245 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39,8■■■■□ 3,96
Pkd2O35245 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,8■■■■□ 3,96
Pkd2O35245 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Pkd2O35245 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,72■■■■□ 3,95
Pkd2O35245 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Pkd2O35245 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,94
Pkd2O35245 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Pkd2O35245 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Pkd2O35245 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Pkd2O35245 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
Pkd2O35245 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39,56■■■■□ 3,92
Pkd2O35245 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Pkd2O35245 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
Pkd2O35245 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Pkd2O35245 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Pkd2O35245 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Pkd2O35245 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Pkd2O35245 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39,35■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
Pkd2O35245 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,29■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39,28■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Pkd2O35245 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Pkd2O35245 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,2■■■■□ 3,87
Pkd2O35245 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Pkd2O35245 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Pkd2O35245 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Pkd2O35245 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Pkd2O35245 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Pkd2O35245 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Pkd2O35245 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Pkd2O35245 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Pkd2O35245 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Pkd2O35245 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Pkd2O35245 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Pkd2O35245 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Pkd2O35245 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Pkd2O35245 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Pkd2O35245 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Pkd2O35245 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Pkd2O35245 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Pkd2O35245 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Pkd2O35245 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Pkd2O35245 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Pkd2O35245 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Pkd2O35245 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Pkd2O35245 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Pkd2O35245 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Pkd2O35245 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Pkd2O35245 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,39■■■■□ 3,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,3 ms