Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcns1O35173 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcns1O35173 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcns1O35173 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcns1O35173 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcns1O35173 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms