Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc23O35125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc23O35125 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc23O35125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms