Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc23O35125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc23O35125 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc23O35125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc23O35125 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc23O35125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc23O35125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc23O35125 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc23O35125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc23O35125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc23O35125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc23O35125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc23O35125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc23O35125 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc23O35125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc23O35125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc23O35125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc23O35125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc23O35125 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc23O35125 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc23O35125 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms