Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra3O35118 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra3O35118 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra3O35118 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra3O35118 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra3O35118 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra3O35118 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gfra3O35118 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra3O35118 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra3O35118 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra3O35118 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra3O35118 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra3O35118 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra3O35118 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra3O35118 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra3O35118 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra3O35118 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra3O35118 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra3O35118 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra3O35118 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra3O35118 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra3O35118 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra3O35118 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra3O35118 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfra3O35118 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra3O35118 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra3O35118 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra3O35118 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra3O35118 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra3O35118 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra3O35118 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra3O35118 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra3O35118 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra3O35118 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra3O35118 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra3O35118 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra3O35118 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra3O35118 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra3O35118 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra3O35118 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gfra3O35118 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra3O35118 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra3O35118 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra3O35118 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra3O35118 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra3O35118 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra3O35118 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra3O35118 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra3O35118 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra3O35118 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra3O35118 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra3O35118 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra3O35118 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra3O35118 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra3O35118 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra3O35118 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra3O35118 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra3O35118 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra3O35118 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra3O35118 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra3O35118 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra3O35118 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra3O35118 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra3O35118 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra3O35118 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra3O35118 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra3O35118 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra3O35118 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra3O35118 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra3O35118 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms