Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kif3cO35066 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kif3cO35066 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif3cO35066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kif3cO35066 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kif3cO35066 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif3cO35066 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kif3cO35066 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kif3cO35066 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kif3cO35066 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif3cO35066 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif3cO35066 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif3cO35066 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kif3cO35066 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3cO35066 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kif3cO35066 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms