Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kif3cO35066 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kif3cO35066 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kif3cO35066 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif3cO35066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kif3cO35066 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kif3cO35066 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kif3cO35066 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif3cO35066 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kif3cO35066 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kif3cO35066 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kif3cO35066 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kif3cO35066 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kif3cO35066 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif3cO35066 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kif3cO35066 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3cO35066 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif3cO35066 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif3cO35066 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kif3cO35066 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kif3cO35066 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kif3cO35066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kif3cO35066 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kif3cO35066 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kif3cO35066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif3cO35066 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif3cO35066 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3cO35066 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kif3cO35066 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3cO35066 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kif3cO35066 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms