Protein–RNA interactions for Protein: O09114

Ptgds, Prostaglandin-H2 D-isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdsO09114 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PtgdsO09114 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
PtgdsO09114 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
PtgdsO09114 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
PtgdsO09114 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
PtgdsO09114 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
PtgdsO09114 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
PtgdsO09114 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
PtgdsO09114 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
PtgdsO09114 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
PtgdsO09114 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
PtgdsO09114 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,43■■□□□ 1,98
PtgdsO09114 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
PtgdsO09114 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
PtgdsO09114 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
PtgdsO09114 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
PtgdsO09114 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
PtgdsO09114 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PtgdsO09114 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
PtgdsO09114 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
PtgdsO09114 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
PtgdsO09114 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
PtgdsO09114 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PtgdsO09114 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PtgdsO09114 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
PtgdsO09114 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PtgdsO09114 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
PtgdsO09114 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
PtgdsO09114 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
PtgdsO09114 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
PtgdsO09114 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
PtgdsO09114 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
PtgdsO09114 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
PtgdsO09114 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
PtgdsO09114 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
PtgdsO09114 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
PtgdsO09114 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
PtgdsO09114 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
PtgdsO09114 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
PtgdsO09114 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
PtgdsO09114 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
PtgdsO09114 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
PtgdsO09114 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
PtgdsO09114 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
PtgdsO09114 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
PtgdsO09114 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
PtgdsO09114 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
PtgdsO09114 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
PtgdsO09114 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
PtgdsO09114 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
PtgdsO09114 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
PtgdsO09114 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
PtgdsO09114 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
PtgdsO09114 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,85
PtgdsO09114 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
PtgdsO09114 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
PtgdsO09114 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
PtgdsO09114 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,51■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
PtgdsO09114 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
PtgdsO09114 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
PtgdsO09114 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
PtgdsO09114 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
PtgdsO09114 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
PtgdsO09114 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
PtgdsO09114 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
PtgdsO09114 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
PtgdsO09114 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
PtgdsO09114 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
PtgdsO09114 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
PtgdsO09114 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
PtgdsO09114 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
PtgdsO09114 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
PtgdsO09114 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
PtgdsO09114 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
PtgdsO09114 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
PtgdsO09114 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
PtgdsO09114 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
PtgdsO09114 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
PtgdsO09114 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms