Protein–RNA interactions for Protein: O09039

Sh2b3, SH2B adapter protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b3O09039 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2b3O09039 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2b3O09039 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b3O09039 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b3O09039 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b3O09039 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b3O09039 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b3O09039 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2b3O09039 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2b3O09039 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh2b3O09039 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh2b3O09039 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2b3O09039 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2b3O09039 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh2b3O09039 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh2b3O09039 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2b3O09039 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh2b3O09039 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh2b3O09039 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh2b3O09039 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh2b3O09039 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh2b3O09039 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2b3O09039 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2b3O09039 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2b3O09039 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2b3O09039 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2b3O09039 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2b3O09039 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2b3O09039 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2b3O09039 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2b3O09039 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2b3O09039 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2b3O09039 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2b3O09039 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2b3O09039 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2b3O09039 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh2b3O09039 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh2b3O09039 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2b3O09039 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2b3O09039 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh2b3O09039 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2b3O09039 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2b3O09039 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2b3O09039 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2b3O09039 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh2b3O09039 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2b3O09039 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh2b3O09039 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh2b3O09039 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b3O09039 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2b3O09039 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2b3O09039 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b3O09039 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b3O09039 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b3O09039 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b3O09039 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b3O09039 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b3O09039 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh2b3O09039 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b3O09039 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b3O09039 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b3O09039 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b3O09039 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2b3O09039 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2b3O09039 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2b3O09039 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b3O09039 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b3O09039 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b3O09039 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2b3O09039 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms