Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps1O08983 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps1O08983 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps1O08983 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps1O08983 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps1O08983 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps1O08983 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps1O08983 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps1O08983 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps1O08983 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps1O08983 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps1O08983 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps1O08983 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps1O08983 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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