Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NumblO08919 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NumblO08919 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NumblO08919 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NumblO08919 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NumblO08919 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NumblO08919 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NumblO08919 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NumblO08919 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NumblO08919 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NumblO08919 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NumblO08919 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NumblO08919 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NumblO08919 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NumblO08919 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NumblO08919 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NumblO08919 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NumblO08919 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NumblO08919 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NumblO08919 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NumblO08919 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NumblO08919 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NumblO08919 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NumblO08919 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NumblO08919 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NumblO08919 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NumblO08919 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NumblO08919 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NumblO08919 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NumblO08919 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NumblO08919 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NumblO08919 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NumblO08919 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NumblO08919 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NumblO08919 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NumblO08919 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NumblO08919 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NumblO08919 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NumblO08919 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NumblO08919 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NumblO08919 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NumblO08919 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NumblO08919 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NumblO08919 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NumblO08919 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NumblO08919 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NumblO08919 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NumblO08919 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NumblO08919 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NumblO08919 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NumblO08919 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NumblO08919 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NumblO08919 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NumblO08919 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NumblO08919 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NumblO08919 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NumblO08919 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NumblO08919 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NumblO08919 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NumblO08919 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NumblO08919 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NumblO08919 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NumblO08919 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NumblO08919 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NumblO08919 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NumblO08919 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NumblO08919 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NumblO08919 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NumblO08919 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NumblO08919 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NumblO08919 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NumblO08919 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NumblO08919 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NumblO08919 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NumblO08919 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NumblO08919 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NumblO08919 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NumblO08919 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NumblO08919 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NumblO08919 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NumblO08919 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NumblO08919 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NumblO08919 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NumblO08919 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NumblO08919 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NumblO08919 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NumblO08919 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NumblO08919 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NumblO08919 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NumblO08919 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NumblO08919 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NumblO08919 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NumblO08919 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NumblO08919 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NumblO08919 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NumblO08919 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NumblO08919 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NumblO08919 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NumblO08919 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NumblO08919 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.1 ms