Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Myh11O08638 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Myh11O08638 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Myh11O08638 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Myh11O08638 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Myh11O08638 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Myh11O08638 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Myh11O08638 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Myh11O08638 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Myh11O08638 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Myh11O08638 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Myh11O08638 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,45■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Myh11O08638 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Myh11O08638 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Myh11O08638 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Myh11O08638 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Myh11O08638 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Myh11O08638 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Myh11O08638 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Myh11O08638 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Myh11O08638 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Myh11O08638 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Myh11O08638 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Myh11O08638 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Myh11O08638 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Myh11O08638 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Myh11O08638 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myh11O08638 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myh11O08638 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myh11O08638 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Myh11O08638 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,01■■■□□ 2,4
Myh11O08638 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Myh11O08638 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Myh11O08638 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Myh11O08638 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Myh11O08638 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Myh11O08638 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Myh11O08638 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Myh11O08638 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Myh11O08638 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Myh11O08638 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Myh11O08638 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Myh11O08638 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Myh11O08638 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Myh11O08638 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Myh11O08638 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Myh11O08638 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Myh11O08638 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Myh11O08638 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Myh11O08638 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Myh11O08638 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Myh11O08638 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Myh11O08638 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Myh11O08638 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Myh11O08638 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Myh11O08638 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Myh11O08638 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Myh11O08638 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Myh11O08638 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Myh11O08638 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Myh11O08638 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Myh11O08638 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Myh11O08638 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Myh11O08638 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Myh11O08638 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Myh11O08638 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Myh11O08638 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Myh11O08638 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Myh11O08638 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Myh11O08638 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Myh11O08638 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Myh11O08638 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Myh11O08638 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Myh11O08638 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Myh11O08638 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Myh11O08638 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Myh11O08638 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Myh11O08638 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Myh11O08638 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Myh11O08638 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Myh11O08638 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Myh11O08638 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Myh11O08638 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms