Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700122O11RikJ3QPW6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700122O11RikJ3QPW6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700122O11RikJ3QPW6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700122O11RikJ3QPW6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700122O11RikJ3QPW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700122O11RikJ3QPW6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700122O11RikJ3QPW6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700122O11RikJ3QPW6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700122O11RikJ3QPW6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700122O11RikJ3QPW6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700122O11RikJ3QPW6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700122O11RikJ3QPW6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700122O11RikJ3QPW6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700122O11RikJ3QPW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700122O11RikJ3QPW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700122O11RikJ3QPW6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
1700122O11RikJ3QPW6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700122O11RikJ3QPW6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1700122O11RikJ3QPW6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700122O11RikJ3QPW6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700122O11RikJ3QPW6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700122O11RikJ3QPW6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700122O11RikJ3QPW6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700122O11RikJ3QPW6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700122O11RikJ3QPW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700122O11RikJ3QPW6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700122O11RikJ3QPW6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
1700122O11RikJ3QPW6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700122O11RikJ3QPW6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700122O11RikJ3QPW6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700122O11RikJ3QPW6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700122O11RikJ3QPW6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700122O11RikJ3QPW6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700122O11RikJ3QPW6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700122O11RikJ3QPW6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
1700122O11RikJ3QPW6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700122O11RikJ3QPW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700122O11RikJ3QPW6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700122O11RikJ3QPW6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700122O11RikJ3QPW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700122O11RikJ3QPW6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700122O11RikJ3QPW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700122O11RikJ3QPW6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700122O11RikJ3QPW6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700122O11RikJ3QPW6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700122O11RikJ3QPW6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700122O11RikJ3QPW6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700122O11RikJ3QPW6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700122O11RikJ3QPW6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700122O11RikJ3QPW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700122O11RikJ3QPW6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700122O11RikJ3QPW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700122O11RikJ3QPW6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms