Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5849J3QPE5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5849J3QPE5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5849J3QPE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5849J3QPE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5849J3QPE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5849J3QPE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5849J3QPE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5849J3QPE5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5849J3QPE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5849J3QPE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5849J3QPE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5849J3QPE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5849J3QPE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5849J3QPE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5849J3QPE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5849J3QPE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5849J3QPE5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5849J3QPE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5849J3QPE5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5849J3QPE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5849J3QPE5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5849J3QPE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5849J3QPE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5849J3QPE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5849J3QPE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5849J3QPE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5849J3QPE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm5849J3QPE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5849J3QPE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5849J3QPE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5849J3QPE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5849J3QPE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5849J3QPE5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5849J3QPE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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