Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim55G3X8Y1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim55G3X8Y1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim55G3X8Y1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim55G3X8Y1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim55G3X8Y1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim55G3X8Y1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim55G3X8Y1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim55G3X8Y1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim55G3X8Y1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim55G3X8Y1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim55G3X8Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim55G3X8Y1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim55G3X8Y1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim55G3X8Y1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim55G3X8Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim55G3X8Y1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim55G3X8Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim55G3X8Y1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim55G3X8Y1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim55G3X8Y1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim55G3X8Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim55G3X8Y1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim55G3X8Y1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim55G3X8Y1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim55G3X8Y1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim55G3X8Y1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim55G3X8Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim55G3X8Y1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim55G3X8Y1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim55G3X8Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim55G3X8Y1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim55G3X8Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim55G3X8Y1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim55G3X8Y1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim55G3X8Y1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim55G3X8Y1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim55G3X8Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim55G3X8Y1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim55G3X8Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim55G3X8Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim55G3X8Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim55G3X8Y1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim55G3X8Y1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim55G3X8Y1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim55G3X8Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim55G3X8Y1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim55G3X8Y1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim55G3X8Y1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim55G3X8Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim55G3X8Y1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim55G3X8Y1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim55G3X8Y1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim55G3X8Y1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim55G3X8Y1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim55G3X8Y1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim55G3X8Y1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim55G3X8Y1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim55G3X8Y1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim55G3X8Y1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim55G3X8Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim55G3X8Y1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim55G3X8Y1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim55G3X8Y1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim55G3X8Y1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms