Protein–RNA interactions for Protein: G3UX18

Gm20726, Predicted gene, 20726, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20726G3UX18 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20726G3UX18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20726G3UX18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20726G3UX18 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20726G3UX18 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20726G3UX18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20726G3UX18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20726G3UX18 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20726G3UX18 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20726G3UX18 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20726G3UX18 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20726G3UX18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20726G3UX18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20726G3UX18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20726G3UX18 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20726G3UX18 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20726G3UX18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20726G3UX18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20726G3UX18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms