Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm44G3UW88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm44G3UW88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm44G3UW88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm44G3UW88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm44G3UW88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm44G3UW88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm44G3UW88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm44G3UW88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm44G3UW88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm44G3UW88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm44G3UW88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms