Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XntrpcF8VQM8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XntrpcF8VQM8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
XntrpcF8VQM8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XntrpcF8VQM8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XntrpcF8VQM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XntrpcF8VQM8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XntrpcF8VQM8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XntrpcF8VQM8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XntrpcF8VQM8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XntrpcF8VQM8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XntrpcF8VQM8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XntrpcF8VQM8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XntrpcF8VQM8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
XntrpcF8VQM8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XntrpcF8VQM8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XntrpcF8VQM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XntrpcF8VQM8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
XntrpcF8VQM8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XntrpcF8VQM8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XntrpcF8VQM8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XntrpcF8VQM8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XntrpcF8VQM8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XntrpcF8VQM8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XntrpcF8VQM8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XntrpcF8VQM8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
XntrpcF8VQM8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XntrpcF8VQM8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XntrpcF8VQM8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XntrpcF8VQM8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XntrpcF8VQM8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XntrpcF8VQM8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XntrpcF8VQM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XntrpcF8VQM8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XntrpcF8VQM8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XntrpcF8VQM8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XntrpcF8VQM8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
XntrpcF8VQM8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XntrpcF8VQM8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XntrpcF8VQM8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XntrpcF8VQM8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
XntrpcF8VQM8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XntrpcF8VQM8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XntrpcF8VQM8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XntrpcF8VQM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XntrpcF8VQM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XntrpcF8VQM8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XntrpcF8VQM8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XntrpcF8VQM8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XntrpcF8VQM8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XntrpcF8VQM8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XntrpcF8VQM8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XntrpcF8VQM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XntrpcF8VQM8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XntrpcF8VQM8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XntrpcF8VQM8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XntrpcF8VQM8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XntrpcF8VQM8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XntrpcF8VQM8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XntrpcF8VQM8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XntrpcF8VQM8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XntrpcF8VQM8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XntrpcF8VQM8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms