Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8220F6YKI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm8220F6YKI2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8220F6YKI2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8220F6YKI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8220F6YKI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8220F6YKI2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8220F6YKI2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8220F6YKI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8220F6YKI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8220F6YKI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8220F6YKI2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8220F6YKI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8220F6YKI2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8220F6YKI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8220F6YKI2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8220F6YKI2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm8220F6YKI2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8220F6YKI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8220F6YKI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8220F6YKI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8220F6YKI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8220F6YKI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8220F6YKI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8220F6YKI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8220F6YKI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8220F6YKI2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8220F6YKI2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8220F6YKI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8220F6YKI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8220F6YKI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8220F6YKI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8220F6YKI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms