Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod3E9QA62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod3E9QA62 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lmod3E9QA62 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod3E9QA62 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lmod3E9QA62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod3E9QA62 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod3E9QA62 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod3E9QA62 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmod3E9QA62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod3E9QA62 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod3E9QA62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmod3E9QA62 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmod3E9QA62 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmod3E9QA62 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmod3E9QA62 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod3E9QA62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod3E9QA62 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmod3E9QA62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod3E9QA62 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmod3E9QA62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod3E9QA62 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod3E9QA62 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod3E9QA62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod3E9QA62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod3E9QA62 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod3E9QA62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmod3E9QA62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmod3E9QA62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod3E9QA62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod3E9QA62 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod3E9QA62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod3E9QA62 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod3E9QA62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lmod3E9QA62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod3E9QA62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Lmod3E9QA62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod3E9QA62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod3E9QA62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmod3E9QA62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod3E9QA62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod3E9QA62 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod3E9QA62 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lmod3E9QA62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lmod3E9QA62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lmod3E9QA62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lmod3E9QA62 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lmod3E9QA62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lmod3E9QA62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lmod3E9QA62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lmod3E9QA62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod3E9QA62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod3E9QA62 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod3E9QA62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmod3E9QA62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmod3E9QA62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod3E9QA62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lmod3E9QA62 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lmod3E9QA62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmod3E9QA62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmod3E9QA62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms