Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Speer4f2E9Q366 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Speer4f2E9Q366 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4f2E9Q366 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4f2E9Q366 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Speer4f2E9Q366 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4f2E9Q366 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f2E9Q366 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Speer4f2E9Q366 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4f2E9Q366 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Speer4f2E9Q366 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4f2E9Q366 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4f2E9Q366 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Speer4f2E9Q366 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4f2E9Q366 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Speer4f2E9Q366 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Speer4f2E9Q366 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4f2E9Q366 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4f2E9Q366 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f2E9Q366 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4f2E9Q366 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Speer4f2E9Q366 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Speer4f2E9Q366 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4f2E9Q366 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4f2E9Q366 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f2E9Q366 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f2E9Q366 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Speer4f2E9Q366 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4f2E9Q366 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f2E9Q366 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4f2E9Q366 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4f2E9Q366 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4f2E9Q366 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f2E9Q366 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4f2E9Q366 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4f2E9Q366 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f2E9Q366 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f2E9Q366 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4f2E9Q366 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4f2E9Q366 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f2E9Q366 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f2E9Q366 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4f2E9Q366 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f2E9Q366 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f2E9Q366 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f2E9Q366 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f2E9Q366 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f2E9Q366 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4f2E9Q366 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f2E9Q366 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4f2E9Q366 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4f2E9Q366 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4f2E9Q366 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4f2E9Q366 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4f2E9Q366 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f2E9Q366 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4f2E9Q366 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f2E9Q366 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f2E9Q366 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f2E9Q366 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f2E9Q366 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4f2E9Q366 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4f2E9Q366 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f2E9Q366 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f2E9Q366 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f2E9Q366 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f2E9Q366 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4f2E9Q366 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Speer4f2E9Q366 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f2E9Q366 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f2E9Q366 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f2E9Q366 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f2E9Q366 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4f2E9Q366 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms