Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Cep350E9Q309 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep350E9Q309 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep350E9Q309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cep350E9Q309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep350E9Q309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep350E9Q309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep350E9Q309 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep350E9Q309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep350E9Q309 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep350E9Q309 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cep350E9Q309 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cep350E9Q309 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cep350E9Q309 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cep350E9Q309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cep350E9Q309 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cep350E9Q309 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cep350E9Q309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cep350E9Q309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cep350E9Q309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cep350E9Q309 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cep350E9Q309 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cep350E9Q309 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cep350E9Q309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cep350E9Q309 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cep350E9Q309 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
Cep350E9Q309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cep350E9Q309 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cep350E9Q309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cep350E9Q309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cep350E9Q309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cep350E9Q309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cep350E9Q309 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep350E9Q309 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep350E9Q309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep350E9Q309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep350E9Q309 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cep350E9Q309 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep350E9Q309 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep350E9Q309 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep350E9Q309 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep350E9Q309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep350E9Q309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep350E9Q309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep350E9Q309 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep350E9Q309 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cep350E9Q309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep350E9Q309 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep350E9Q309 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep350E9Q309 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep350E9Q309 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep350E9Q309 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cep350E9Q309 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep350E9Q309 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep350E9Q309 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep350E9Q309 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep350E9Q309 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep350E9Q309 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep350E9Q309 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep350E9Q309 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep350E9Q309 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep350E9Q309 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep350E9Q309 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep350E9Q309 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep350E9Q309 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep350E9Q309 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep350E9Q309 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep350E9Q309 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep350E9Q309 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep350E9Q309 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep350E9Q309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep350E9Q309 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms