Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2H5

Gm3233, Predicted gene 3233, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3233E9Q2H5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3233E9Q2H5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3233E9Q2H5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3233E9Q2H5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3233E9Q2H5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3233E9Q2H5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3233E9Q2H5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3233E9Q2H5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3233E9Q2H5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3233E9Q2H5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3233E9Q2H5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3233E9Q2H5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3233E9Q2H5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3233E9Q2H5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3233E9Q2H5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3233E9Q2H5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3233E9Q2H5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3233E9Q2H5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3233E9Q2H5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3233E9Q2H5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3233E9Q2H5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3233E9Q2H5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3233E9Q2H5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3233E9Q2H5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3233E9Q2H5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3233E9Q2H5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3233E9Q2H5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3233E9Q2H5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3233E9Q2H5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3233E9Q2H5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3233E9Q2H5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3233E9Q2H5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3233E9Q2H5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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