Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt90E9Q1Z0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt90E9Q1Z0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt90E9Q1Z0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt90E9Q1Z0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt90E9Q1Z0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt90E9Q1Z0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt90E9Q1Z0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt90E9Q1Z0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt90E9Q1Z0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt90E9Q1Z0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt90E9Q1Z0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt90E9Q1Z0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt90E9Q1Z0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt90E9Q1Z0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt90E9Q1Z0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt90E9Q1Z0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt90E9Q1Z0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt90E9Q1Z0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt90E9Q1Z0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt90E9Q1Z0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt90E9Q1Z0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt90E9Q1Z0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt90E9Q1Z0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt90E9Q1Z0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt90E9Q1Z0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt90E9Q1Z0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt90E9Q1Z0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt90E9Q1Z0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt90E9Q1Z0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt90E9Q1Z0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt90E9Q1Z0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt90E9Q1Z0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt90E9Q1Z0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt90E9Q1Z0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt90E9Q1Z0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt90E9Q1Z0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt90E9Q1Z0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt90E9Q1Z0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt90E9Q1Z0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt90E9Q1Z0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt90E9Q1Z0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt90E9Q1Z0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt90E9Q1Z0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt90E9Q1Z0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt90E9Q1Z0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt90E9Q1Z0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt90E9Q1Z0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt90E9Q1Z0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt90E9Q1Z0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt90E9Q1Z0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt90E9Q1Z0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt90E9Q1Z0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt90E9Q1Z0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt90E9Q1Z0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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