Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ccdc171E9Q1U1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,51■■■■□ 3,27
Ccdc171E9Q1U1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ccdc171E9Q1U1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Ccdc171E9Q1U1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Ccdc171E9Q1U1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Ccdc171E9Q1U1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ccdc171E9Q1U1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Ccdc171E9Q1U1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Ccdc171E9Q1U1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Ccdc171E9Q1U1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Ccdc171E9Q1U1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
Ccdc171E9Q1U1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Ccdc171E9Q1U1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ccdc171E9Q1U1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Ccdc171E9Q1U1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Ccdc171E9Q1U1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Ccdc171E9Q1U1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ccdc171E9Q1U1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ccdc171E9Q1U1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Ccdc171E9Q1U1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Ccdc171E9Q1U1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Ccdc171E9Q1U1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ccdc171E9Q1U1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Ccdc171E9Q1U1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Ccdc171E9Q1U1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Ccdc171E9Q1U1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Ccdc171E9Q1U1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Ccdc171E9Q1U1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Ccdc171E9Q1U1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ccdc171E9Q1U1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Ccdc171E9Q1U1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Ccdc171E9Q1U1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ccdc171E9Q1U1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ccdc171E9Q1U1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Ccdc171E9Q1U1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Ccdc171E9Q1U1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Ccdc171E9Q1U1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ccdc171E9Q1U1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Ccdc171E9Q1U1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ccdc171E9Q1U1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ccdc171E9Q1U1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Ccdc171E9Q1U1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ccdc171E9Q1U1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Ccdc171E9Q1U1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Ccdc171E9Q1U1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ccdc171E9Q1U1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ccdc171E9Q1U1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ccdc171E9Q1U1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Ccdc171E9Q1U1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccdc171E9Q1U1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ccdc171E9Q1U1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,07■■■■□ 3,05
Ccdc171E9Q1U1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ccdc171E9Q1U1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Ccdc171E9Q1U1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Ccdc171E9Q1U1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Ccdc171E9Q1U1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ccdc171E9Q1U1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Ccdc171E9Q1U1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ccdc171E9Q1U1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ccdc171E9Q1U1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ccdc171E9Q1U1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccdc171E9Q1U1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Ccdc171E9Q1U1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Ccdc171E9Q1U1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,77■■■■□ 3
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