Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfp558E9Q1J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp558E9Q1J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp558E9Q1J0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp558E9Q1J0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp558E9Q1J0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp558E9Q1J0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp558E9Q1J0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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