Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gcom1E9PZ54 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gcom1E9PZ54 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gcom1E9PZ54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gcom1E9PZ54 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gcom1E9PZ54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gcom1E9PZ54 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gcom1E9PZ54 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gcom1E9PZ54 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gcom1E9PZ54 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gcom1E9PZ54 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gcom1E9PZ54 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gcom1E9PZ54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gcom1E9PZ54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gcom1E9PZ54 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gcom1E9PZ54 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gcom1E9PZ54 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Gcom1E9PZ54 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gcom1E9PZ54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gcom1E9PZ54 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gcom1E9PZ54 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gcom1E9PZ54 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gcom1E9PZ54 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gcom1E9PZ54 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gcom1E9PZ54 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gcom1E9PZ54 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gcom1E9PZ54 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gcom1E9PZ54 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gcom1E9PZ54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gcom1E9PZ54 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gcom1E9PZ54 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gcom1E9PZ54 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gcom1E9PZ54 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gcom1E9PZ54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gcom1E9PZ54 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gcom1E9PZ54 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gcom1E9PZ54 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gcom1E9PZ54 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcom1E9PZ54 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gcom1E9PZ54 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gcom1E9PZ54 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gcom1E9PZ54 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gcom1E9PZ54 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gcom1E9PZ54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gcom1E9PZ54 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gcom1E9PZ54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gcom1E9PZ54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gcom1E9PZ54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gcom1E9PZ54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gcom1E9PZ54 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gcom1E9PZ54 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcom1E9PZ54 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Gcom1E9PZ54 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gcom1E9PZ54 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gcom1E9PZ54 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gcom1E9PZ54 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gcom1E9PZ54 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcom1E9PZ54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcom1E9PZ54 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcom1E9PZ54 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcom1E9PZ54 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcom1E9PZ54 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcom1E9PZ54 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcom1E9PZ54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcom1E9PZ54 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms