Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tgfbr3lD3YZZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfbr3lD3YZZ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tgfbr3lD3YZZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tgfbr3lD3YZZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfbr3lD3YZZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfbr3lD3YZZ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfbr3lD3YZZ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfbr3lD3YZZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfbr3lD3YZZ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms