Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Tgfbr3lD3YZZ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tgfbr3lD3YZZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tgfbr3lD3YZZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tgfbr3lD3YZZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tgfbr3lD3YZZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tgfbr3lD3YZZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tgfbr3lD3YZZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tgfbr3lD3YZZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tgfbr3lD3YZZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Tgfbr3lD3YZZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tgfbr3lD3YZZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tgfbr3lD3YZZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Tgfbr3lD3YZZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Tgfbr3lD3YZZ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tgfbr3lD3YZZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Tgfbr3lD3YZZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Tgfbr3lD3YZZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Tgfbr3lD3YZZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Tgfbr3lD3YZZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Tgfbr3lD3YZZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tgfbr3lD3YZZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tgfbr3lD3YZZ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tgfbr3lD3YZZ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tgfbr3lD3YZZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tgfbr3lD3YZZ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms