Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppfia4B8QI36 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppfia4B8QI36 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppfia4B8QI36 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppfia4B8QI36 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppfia4B8QI36 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia4B8QI36 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia4B8QI36 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppfia4B8QI36 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppfia4B8QI36 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppfia4B8QI36 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfia4B8QI36 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfia4B8QI36 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppfia4B8QI36 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppfia4B8QI36 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfia4B8QI36 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppfia4B8QI36 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppfia4B8QI36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppfia4B8QI36 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppfia4B8QI36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfia4B8QI36 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfia4B8QI36 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfia4B8QI36 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppfia4B8QI36 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppfia4B8QI36 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppfia4B8QI36 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppfia4B8QI36 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppfia4B8QI36 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppfia4B8QI36 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppfia4B8QI36 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppfia4B8QI36 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia4B8QI36 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppfia4B8QI36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppfia4B8QI36 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppfia4B8QI36 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppfia4B8QI36 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppfia4B8QI36 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppfia4B8QI36 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppfia4B8QI36 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppfia4B8QI36 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppfia4B8QI36 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppfia4B8QI36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppfia4B8QI36 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppfia4B8QI36 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppfia4B8QI36 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia4B8QI36 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia4B8QI36 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia4B8QI36 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfia4B8QI36 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfia4B8QI36 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppfia4B8QI36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppfia4B8QI36 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfia4B8QI36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfia4B8QI36 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfia4B8QI36 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppfia4B8QI36 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppfia4B8QI36 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppfia4B8QI36 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppfia4B8QI36 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppfia4B8QI36 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia4B8QI36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppfia4B8QI36 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppfia4B8QI36 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfia4B8QI36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppfia4B8QI36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia4B8QI36 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppfia4B8QI36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia4B8QI36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia4B8QI36 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia4B8QI36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia4B8QI36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfia4B8QI36 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms