Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cspp1B2RX88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cspp1B2RX88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cspp1B2RX88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cspp1B2RX88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Cspp1B2RX88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cspp1B2RX88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cspp1B2RX88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cspp1B2RX88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cspp1B2RX88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cspp1B2RX88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cspp1B2RX88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cspp1B2RX88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cspp1B2RX88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Cspp1B2RX88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cspp1B2RX88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cspp1B2RX88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Cspp1B2RX88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cspp1B2RX88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cspp1B2RX88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cspp1B2RX88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cspp1B2RX88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cspp1B2RX88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cspp1B2RX88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cspp1B2RX88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cspp1B2RX88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cspp1B2RX88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cspp1B2RX88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cspp1B2RX88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cspp1B2RX88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cspp1B2RX88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cspp1B2RX88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cspp1B2RX88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cspp1B2RX88 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cspp1B2RX88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cspp1B2RX88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cspp1B2RX88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cspp1B2RX88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cspp1B2RX88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cspp1B2RX88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cspp1B2RX88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cspp1B2RX88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cspp1B2RX88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cspp1B2RX88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cspp1B2RX88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cspp1B2RX88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cspp1B2RX88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cspp1B2RX88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cspp1B2RX88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cspp1B2RX88 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cspp1B2RX88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cspp1B2RX88 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cspp1B2RX88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cspp1B2RX88 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cspp1B2RX88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cspp1B2RX88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cspp1B2RX88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cspp1B2RX88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cspp1B2RX88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cspp1B2RX88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cspp1B2RX88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cspp1B2RX88 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cspp1B2RX88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cspp1B2RX88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cspp1B2RX88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cspp1B2RX88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cspp1B2RX88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cspp1B2RX88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cspp1B2RX88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cspp1B2RX88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Cspp1B2RX88 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms