Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Apba1B2RUJ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Apba1B2RUJ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Apba1B2RUJ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Apba1B2RUJ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Apba1B2RUJ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Apba1B2RUJ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Apba1B2RUJ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Apba1B2RUJ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Apba1B2RUJ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Apba1B2RUJ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Apba1B2RUJ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Apba1B2RUJ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Apba1B2RUJ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Apba1B2RUJ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Apba1B2RUJ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Apba1B2RUJ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Apba1B2RUJ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Apba1B2RUJ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Apba1B2RUJ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Apba1B2RUJ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Apba1B2RUJ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Apba1B2RUJ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Apba1B2RUJ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Apba1B2RUJ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Apba1B2RUJ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Apba1B2RUJ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apba1B2RUJ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apba1B2RUJ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Apba1B2RUJ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Apba1B2RUJ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Apba1B2RUJ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Apba1B2RUJ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Apba1B2RUJ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Apba1B2RUJ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Apba1B2RUJ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Apba1B2RUJ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apba1B2RUJ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Apba1B2RUJ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Apba1B2RUJ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Apba1B2RUJ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Apba1B2RUJ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Apba1B2RUJ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Apba1B2RUJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Apba1B2RUJ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Apba1B2RUJ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Apba1B2RUJ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Apba1B2RUJ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Apba1B2RUJ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apba1B2RUJ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Apba1B2RUJ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Apba1B2RUJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Apba1B2RUJ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Apba1B2RUJ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Apba1B2RUJ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Apba1B2RUJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apba1B2RUJ5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Apba1B2RUJ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Apba1B2RUJ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59,4 ms