Protein–RNA interactions for Protein: B2RSH2

Gnai1, Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnai1B2RSH2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Gnai1B2RSH2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Gnai1B2RSH2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36■■■■□ 3,35
Gnai1B2RSH2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Gnai1B2RSH2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Gnai1B2RSH2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Gnai1B2RSH2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Gnai1B2RSH2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Gnai1B2RSH2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Gnai1B2RSH2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,34
Gnai1B2RSH2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Gnai1B2RSH2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Gnai1B2RSH2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Gnai1B2RSH2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Gnai1B2RSH2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Gnai1B2RSH2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Gnai1B2RSH2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Gnai1B2RSH2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Gnai1B2RSH2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Gnai1B2RSH2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Gnai1B2RSH2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Gnai1B2RSH2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Gnai1B2RSH2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Gnai1B2RSH2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Gnai1B2RSH2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Gnai1B2RSH2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Gnai1B2RSH2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Gnai1B2RSH2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Gnai1B2RSH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Gnai1B2RSH2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Gnai1B2RSH2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Gnai1B2RSH2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Gnai1B2RSH2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Gnai1B2RSH2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Gnai1B2RSH2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Gnai1B2RSH2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Gnai1B2RSH2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Gnai1B2RSH2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Gnai1B2RSH2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
Gnai1B2RSH2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Gnai1B2RSH2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Gnai1B2RSH2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Gnai1B2RSH2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Gnai1B2RSH2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Gnai1B2RSH2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Gnai1B2RSH2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Gnai1B2RSH2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Gnai1B2RSH2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Gnai1B2RSH2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Gnai1B2RSH2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Gnai1B2RSH2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Gnai1B2RSH2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Gnai1B2RSH2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Gnai1B2RSH2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Gnai1B2RSH2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Gnai1B2RSH2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Gnai1B2RSH2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Gnai1B2RSH2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Gnai1B2RSH2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Gnai1B2RSH2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Gnai1B2RSH2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Gnai1B2RSH2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gnai1B2RSH2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Gnai1B2RSH2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Gnai1B2RSH2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Gnai1B2RSH2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Gnai1B2RSH2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Gnai1B2RSH2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Gnai1B2RSH2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Gnai1B2RSH2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Gnai1B2RSH2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Gnai1B2RSH2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Gnai1B2RSH2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Gnai1B2RSH2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Gnai1B2RSH2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Gnai1B2RSH2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Gnai1B2RSH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Gnai1B2RSH2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Gnai1B2RSH2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Gnai1B2RSH2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Gnai1B2RSH2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Gnai1B2RSH2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Gnai1B2RSH2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Gnai1B2RSH2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Gnai1B2RSH2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Gnai1B2RSH2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Gnai1B2RSH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Gnai1B2RSH2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Gnai1B2RSH2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Gnai1B2RSH2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Gnai1B2RSH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Gnai1B2RSH2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Gnai1B2RSH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms