Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cpb1B2RS76 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cpb1B2RS76 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Cpb1B2RS76 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Cpb1B2RS76 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Cpb1B2RS76 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cpb1B2RS76 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cpb1B2RS76 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cpb1B2RS76 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Cpb1B2RS76 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Cpb1B2RS76 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Cpb1B2RS76 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Cpb1B2RS76 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cpb1B2RS76 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cpb1B2RS76 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cpb1B2RS76 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cpb1B2RS76 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cpb1B2RS76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cpb1B2RS76 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Cpb1B2RS76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cpb1B2RS76 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Cpb1B2RS76 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cpb1B2RS76 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cpb1B2RS76 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cpb1B2RS76 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Cpb1B2RS76 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Cpb1B2RS76 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cpb1B2RS76 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cpb1B2RS76 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Cpb1B2RS76 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cpb1B2RS76 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cpb1B2RS76 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cpb1B2RS76 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cpb1B2RS76 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cpb1B2RS76 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cpb1B2RS76 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Cpb1B2RS76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cpb1B2RS76 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cpb1B2RS76 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cpb1B2RS76 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Cpb1B2RS76 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Cpb1B2RS76 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cpb1B2RS76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Cpb1B2RS76 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Cpb1B2RS76 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Cpb1B2RS76 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Cpb1B2RS76 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Cpb1B2RS76 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Cpb1B2RS76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cpb1B2RS76 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Cpb1B2RS76 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Cpb1B2RS76 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cpb1B2RS76 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cpb1B2RS76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cpb1B2RS76 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cpb1B2RS76 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cpb1B2RS76 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cpb1B2RS76 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cpb1B2RS76 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Cpb1B2RS76 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Cpb1B2RS76 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cpb1B2RS76 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cpb1B2RS76 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cpb1B2RS76 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cpb1B2RS76 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cpb1B2RS76 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cpb1B2RS76 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cpb1B2RS76 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cpb1B2RS76 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cpb1B2RS76 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Cpb1B2RS76 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms