Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN4

Atp10b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10bB1AWN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Atp10bB1AWN4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Atp10bB1AWN4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Atp10bB1AWN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Atp10bB1AWN4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Atp10bB1AWN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Atp10bB1AWN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Atp10bB1AWN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Atp10bB1AWN4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Atp10bB1AWN4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Atp10bB1AWN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Atp10bB1AWN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Atp10bB1AWN4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Atp10bB1AWN4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Atp10bB1AWN4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Atp10bB1AWN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Atp10bB1AWN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Atp10bB1AWN4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Atp10bB1AWN4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Atp10bB1AWN4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Atp10bB1AWN4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atp10bB1AWN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atp10bB1AWN4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atp10bB1AWN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Atp10bB1AWN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Atp10bB1AWN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Atp10bB1AWN4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Atp10bB1AWN4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Atp10bB1AWN4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Atp10bB1AWN4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Atp10bB1AWN4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Atp10bB1AWN4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atp10bB1AWN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atp10bB1AWN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Atp10bB1AWN4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Atp10bB1AWN4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Atp10bB1AWN4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Atp10bB1AWN4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Atp10bB1AWN4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Atp10bB1AWN4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atp10bB1AWN4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atp10bB1AWN4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Atp10bB1AWN4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atp10bB1AWN4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atp10bB1AWN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atp10bB1AWN4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Atp10bB1AWN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Atp10bB1AWN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Atp10bB1AWN4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Atp10bB1AWN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Atp10bB1AWN4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Atp10bB1AWN4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Atp10bB1AWN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Atp10bB1AWN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Atp10bB1AWN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Atp10bB1AWN4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atp10bB1AWN4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atp10bB1AWN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atp10bB1AWN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp10bB1AWN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Atp10bB1AWN4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Atp10bB1AWN4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atp10bB1AWN4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Atp10bB1AWN4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Atp10bB1AWN4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Atp10bB1AWN4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10bB1AWN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10bB1AWN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atp10bB1AWN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Atp10bB1AWN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp10bB1AWN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Atp10bB1AWN4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Atp10bB1AWN4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Atp10bB1AWN4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Atp10bB1AWN4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Atp10bB1AWN4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Atp10bB1AWN4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Atp10bB1AWN4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp10bB1AWN4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Atp10bB1AWN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Atp10bB1AWN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Atp10bB1AWN4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Atp10bB1AWN4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms