Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klhl41A2AUC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klhl41A2AUC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klhl41A2AUC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klhl41A2AUC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klhl41A2AUC9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klhl41A2AUC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klhl41A2AUC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klhl41A2AUC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Klhl41A2AUC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klhl41A2AUC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Klhl41A2AUC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhl41A2AUC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhl41A2AUC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhl41A2AUC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhl41A2AUC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl41A2AUC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl41A2AUC9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhl41A2AUC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhl41A2AUC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhl41A2AUC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhl41A2AUC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhl41A2AUC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhl41A2AUC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klhl41A2AUC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Klhl41A2AUC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klhl41A2AUC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klhl41A2AUC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Klhl41A2AUC9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klhl41A2AUC9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klhl41A2AUC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl41A2AUC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Klhl41A2AUC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klhl41A2AUC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Klhl41A2AUC9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl41A2AUC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl41A2AUC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl41A2AUC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Klhl41A2AUC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Klhl41A2AUC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klhl41A2AUC9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klhl41A2AUC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klhl41A2AUC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Klhl41A2AUC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhl41A2AUC9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhl41A2AUC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klhl41A2AUC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl41A2AUC9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhl41A2AUC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhl41A2AUC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Klhl41A2AUC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klhl41A2AUC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl41A2AUC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klhl41A2AUC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klhl41A2AUC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klhl41A2AUC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl41A2AUC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl41A2AUC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klhl41A2AUC9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl41A2AUC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl41A2AUC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl41A2AUC9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klhl41A2AUC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klhl41A2AUC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klhl41A2AUC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Klhl41A2AUC9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klhl41A2AUC9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Klhl41A2AUC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klhl41A2AUC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms