Protein–RNA interactions for Protein: A2AR95

Ldlrad3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad3A2AR95 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad3A2AR95 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad3A2AR95 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad3A2AR95 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ldlrad3A2AR95 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad3A2AR95 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad3A2AR95 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad3A2AR95 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms