Protein–RNA interactions for Protein: A2AR95

Ldlrad3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad3A2AR95 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad3A2AR95 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad3A2AR95 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad3A2AR95 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ldlrad3A2AR95 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ldlrad3A2AR95 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ldlrad3A2AR95 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ldlrad3A2AR95 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ldlrad3A2AR95 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ldlrad3A2AR95 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ldlrad3A2AR95 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad3A2AR95 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ldlrad3A2AR95 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad3A2AR95 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad3A2AR95 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad3A2AR95 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldlrad3A2AR95 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldlrad3A2AR95 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldlrad3A2AR95 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ldlrad3A2AR95 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad3A2AR95 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad3A2AR95 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad3A2AR95 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ldlrad3A2AR95 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms