Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cavin4A2AMM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cavin4A2AMM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cavin4A2AMM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cavin4A2AMM0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cavin4A2AMM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cavin4A2AMM0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cavin4A2AMM0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Cavin4A2AMM0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cavin4A2AMM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cavin4A2AMM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cavin4A2AMM0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cavin4A2AMM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cavin4A2AMM0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cavin4A2AMM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cavin4A2AMM0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cavin4A2AMM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cavin4A2AMM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cavin4A2AMM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cavin4A2AMM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cavin4A2AMM0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cavin4A2AMM0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cavin4A2AMM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cavin4A2AMM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cavin4A2AMM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cavin4A2AMM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cavin4A2AMM0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cavin4A2AMM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cavin4A2AMM0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cavin4A2AMM0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cavin4A2AMM0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cavin4A2AMM0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cavin4A2AMM0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cavin4A2AMM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Cavin4A2AMM0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cavin4A2AMM0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cavin4A2AMM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cavin4A2AMM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cavin4A2AMM0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Cavin4A2AMM0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cavin4A2AMM0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cavin4A2AMM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cavin4A2AMM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cavin4A2AMM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Cavin4A2AMM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cavin4A2AMM0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cavin4A2AMM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cavin4A2AMM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cavin4A2AMM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cavin4A2AMM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cavin4A2AMM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cavin4A2AMM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cavin4A2AMM0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cavin4A2AMM0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cavin4A2AMM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cavin4A2AMM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cavin4A2AMM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cavin4A2AMM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cavin4A2AMM0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Cavin4A2AMM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cavin4A2AMM0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cavin4A2AMM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cavin4A2AMM0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cavin4A2AMM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cavin4A2AMM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Cavin4A2AMM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cavin4A2AMM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cavin4A2AMM0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cavin4A2AMM0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cavin4A2AMM0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cavin4A2AMM0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cavin4A2AMM0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cavin4A2AMM0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cavin4A2AMM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cavin4A2AMM0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cavin4A2AMM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cavin4A2AMM0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cavin4A2AMM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cavin4A2AMM0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cavin4A2AMM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cavin4A2AMM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cavin4A2AMM0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cavin4A2AMM0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cavin4A2AMM0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cavin4A2AMM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cavin4A2AMM0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cavin4A2AMM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cavin4A2AMM0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cavin4A2AMM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms