Protein–RNA interactions for Protein: A2AFI6

Gm364, Transmembrane 9 superfamily member, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm364A2AFI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm364A2AFI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm364A2AFI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm364A2AFI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm364A2AFI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm364A2AFI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm364A2AFI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm364A2AFI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm364A2AFI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm364A2AFI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm364A2AFI6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms