Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Frmd7A2AD83 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Frmd7A2AD83 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Frmd7A2AD83 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Frmd7A2AD83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Frmd7A2AD83 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Frmd7A2AD83 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Frmd7A2AD83 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Frmd7A2AD83 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Frmd7A2AD83 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Frmd7A2AD83 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Frmd7A2AD83 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Frmd7A2AD83 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Frmd7A2AD83 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Frmd7A2AD83 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Frmd7A2AD83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Frmd7A2AD83 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Frmd7A2AD83 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Frmd7A2AD83 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Frmd7A2AD83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Frmd7A2AD83 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Frmd7A2AD83 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Frmd7A2AD83 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Frmd7A2AD83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Frmd7A2AD83 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
Frmd7A2AD83 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Frmd7A2AD83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Frmd7A2AD83 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Frmd7A2AD83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Frmd7A2AD83 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Frmd7A2AD83 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Frmd7A2AD83 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Frmd7A2AD83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Frmd7A2AD83 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,51■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Frmd7A2AD83 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Frmd7A2AD83 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Frmd7A2AD83 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Frmd7A2AD83 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Frmd7A2AD83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Frmd7A2AD83 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Frmd7A2AD83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
Frmd7A2AD83 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Frmd7A2AD83 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Frmd7A2AD83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Frmd7A2AD83 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Frmd7A2AD83 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Frmd7A2AD83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Frmd7A2AD83 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Frmd7A2AD83 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Frmd7A2AD83 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
Frmd7A2AD83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Frmd7A2AD83 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Frmd7A2AD83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Frmd7A2AD83 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Frmd7A2AD83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Frmd7A2AD83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Frmd7A2AD83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Frmd7A2AD83 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Frmd7A2AD83 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Frmd7A2AD83 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Frmd7A2AD83 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,88■■■□□ 2,69
Frmd7A2AD83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Frmd7A2AD83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Frmd7A2AD83 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Frmd7A2AD83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Frmd7A2AD83 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Frmd7A2AD83 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Frmd7A2AD83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Frmd7A2AD83 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Frmd7A2AD83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Frmd7A2AD83 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Frmd7A2AD83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Frmd7A2AD83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Frmd7A2AD83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Frmd7A2AD83 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Frmd7A2AD83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Frmd7A2AD83 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Frmd7A2AD83 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Frmd7A2AD83 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Frmd7A2AD83 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Frmd7A2AD83 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Frmd7A2AD83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Frmd7A2AD83 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Frmd7A2AD83 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Frmd7A2AD83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Frmd7A2AD83 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Frmd7A2AD83 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Frmd7A2AD83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms