Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Calcoco2A2A6M5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Calcoco2A2A6M5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Calcoco2A2A6M5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Calcoco2A2A6M5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Calcoco2A2A6M5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Calcoco2A2A6M5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Calcoco2A2A6M5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Calcoco2A2A6M5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Calcoco2A2A6M5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Calcoco2A2A6M5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Calcoco2A2A6M5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Calcoco2A2A6M5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Calcoco2A2A6M5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Calcoco2A2A6M5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Calcoco2A2A6M5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Calcoco2A2A6M5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Calcoco2A2A6M5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Calcoco2A2A6M5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Calcoco2A2A6M5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Calcoco2A2A6M5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Calcoco2A2A6M5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Calcoco2A2A6M5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Calcoco2A2A6M5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Calcoco2A2A6M5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Calcoco2A2A6M5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Calcoco2A2A6M5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Calcoco2A2A6M5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Calcoco2A2A6M5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Calcoco2A2A6M5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Calcoco2A2A6M5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Calcoco2A2A6M5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Calcoco2A2A6M5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Calcoco2A2A6M5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Calcoco2A2A6M5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Calcoco2A2A6M5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Calcoco2A2A6M5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Calcoco2A2A6M5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Calcoco2A2A6M5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Calcoco2A2A6M5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Calcoco2A2A6M5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Calcoco2A2A6M5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Calcoco2A2A6M5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms