Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N4

Igkv5-37, Immunoglobulin kappa variable 5-37 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv5-37A0A140T8N4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Igkv5-37A0A140T8N4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Igkv5-37A0A140T8N4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Igkv5-37A0A140T8N4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Igkv5-37A0A140T8N4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Igkv5-37A0A140T8N4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Igkv5-37A0A140T8N4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Igkv5-37A0A140T8N4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Igkv5-37A0A140T8N4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Igkv5-37A0A140T8N4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Igkv5-37A0A140T8N4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Igkv5-37A0A140T8N4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Igkv5-37A0A140T8N4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Igkv5-37A0A140T8N4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Igkv5-37A0A140T8N4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Igkv5-37A0A140T8N4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Igkv5-37A0A140T8N4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Igkv5-37A0A140T8N4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Igkv5-37A0A140T8N4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Igkv5-37A0A140T8N4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Igkv5-37A0A140T8N4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Igkv5-37A0A140T8N4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Igkv5-37A0A140T8N4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Igkv5-37A0A140T8N4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Igkv5-37A0A140T8N4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Igkv5-37A0A140T8N4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Igkv5-37A0A140T8N4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Igkv5-37A0A140T8N4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Igkv5-37A0A140T8N4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Igkv5-37A0A140T8N4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Igkv5-37A0A140T8N4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Igkv5-37A0A140T8N4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Igkv5-37A0A140T8N4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Igkv5-37A0A140T8N4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Igkv5-37A0A140T8N4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Igkv5-37A0A140T8N4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igkv5-37A0A140T8N4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Igkv5-37A0A140T8N4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Igkv5-37A0A140T8N4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Igkv5-37A0A140T8N4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Igkv5-37A0A140T8N4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Igkv5-37A0A140T8N4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Igkv5-37A0A140T8N4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Igkv5-37A0A140T8N4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Igkv5-37A0A140T8N4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Igkv5-37A0A140T8N4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Igkv5-37A0A140T8N4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Igkv5-37A0A140T8N4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,08■■□□□ 1,28
Igkv5-37A0A140T8N4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Igkv5-37A0A140T8N4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Igkv5-37A0A140T8N4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Igkv5-37A0A140T8N4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Igkv5-37A0A140T8N4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Igkv5-37A0A140T8N4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Igkv5-37A0A140T8N4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Igkv5-37A0A140T8N4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Igkv5-37A0A140T8N4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms