Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms