Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-18A0A0A6YXN4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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