Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Gm28269A0A087WSG3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Gm28269A0A087WSG3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Gm28269A0A087WSG3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Gm28269A0A087WSG3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Gm28269A0A087WSG3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,72■□□□□ 0,59
Gm28269A0A087WSG3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gm28269A0A087WSG3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,61■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18,6■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
Gm28269A0A087WSG3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,57■□□□□ 0,56
Gm28269A0A087WSG3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,55■□□□□ 0,56
Gm28269A0A087WSG3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm28269A0A087WSG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm28269A0A087WSG3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm28269A0A087WSG3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Gm28269A0A087WSG3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Gm28269A0A087WSG3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm28269A0A087WSG3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,48■□□□□ 0,55
Gm28269A0A087WSG3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm28269A0A087WSG3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,33■□□□□ 0,53
Gm28269A0A087WSG3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Gm28269A0A087WSG3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm28269A0A087WSG3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Gm28269A0A087WSG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,28■□□□□ 0,52
Gm28269A0A087WSG3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Gm28269A0A087WSG3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Gm28269A0A087WSG3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Gm28269A0A087WSG3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm28269A0A087WSG3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm28269A0A087WSG3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm28269A0A087WSG3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm28269A0A087WSG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,9 ms