Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Col5a3Q9JLI2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Col5a3Q9JLI2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Col5a3Q9JLI2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Col5a3Q9JLI2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Col5a3Q9JLI2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms