Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms